More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3954 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  76.97 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  77.48 
 
 		 176 aa  241  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 165 aa  194  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  60.4 
 
 		 157 aa  186  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 168 aa  186  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  59.73 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  49.66 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 181 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  47.1 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.27 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.61 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.95 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  48.23 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 164 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 164 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 164 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  46.48 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.14 
 
 		 229 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  43.45 
 
 		 176 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  43.24 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>