More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1942 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  92.62 
 
 
151 aa  280  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  89.93 
 
 
152 aa  275  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 
152 aa  260  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
145 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  52.78 
 
 
168 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 
176 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 
156 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  52.03 
 
 
160 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
157 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 
152 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 
160 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 
160 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
165 aa  150  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
154 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.72 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.47 
 
 
162 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.82 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
175 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
157 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
154 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
162 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
166 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
162 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  40.13 
 
 
162 aa  123  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  44 
 
 
162 aa  123  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
163 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  38.78 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
152 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
162 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
175 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
159 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
152 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.45 
 
 
229 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
152 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  39.86 
 
 
164 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
178 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.79 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>