More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2906 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  340  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 176 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 157 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  55.06 
 
 		 165 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 152 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 151 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  52.78 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 157 aa  141  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.35 
 
 		 153 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  47.79 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.27 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.27 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.27 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.27 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.95 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.27 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.92 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 202 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  44.59 
 
 		 229 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.06 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  43.54 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 213 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  40.51 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.21 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.21 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>