More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2140 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
154 aa  315  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 
152 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
153 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 
153 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
156 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
157 aa  144  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
147 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
181 aa  140  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
229 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
175 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
154 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
162 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 
229 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
155 aa  133  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
213 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
174 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
155 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
157 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  37.95 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  37.95 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  37.95 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  37.95 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  39.47 
 
 
161 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
161 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
222 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
222 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.65 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  37.58 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  37.35 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  37.58 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  37.35 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
218 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 
150 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
161 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
156 aa  124  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.75 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
155 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
153 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
156 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>