More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0873 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 154 aa  238  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  78.29 
 
 		 157 aa  236  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 156 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 		 154 aa  227  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 158 aa  225  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  73.68 
 
 		 155 aa  224  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 175 aa  193  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  61.59 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  61.59 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  61.59 
 
 		 229 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  61.59 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  61.59 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 202 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 202 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  57.52 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  60.93 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  57.42 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  53.33 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  47.37 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.34 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 169 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  47.4 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  47.47 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  46.11 
 
 		 168 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  48.37 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  46.11 
 
 		 168 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 218 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  45.39 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  45.39 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  45.39 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  46.34 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  46.34 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  46.34 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.34 
 
 		 222 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 181 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 222 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  50.66 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>