More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1555 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  52.94 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  44.52 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  39.19 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  35.06 
 
 		 166 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  36.67 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  38.1 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.09 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.1 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  35.76 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  35.76 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  37.09 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  35.76 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>