More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1372 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  61.29 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  54.55 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  47.3 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  42.38 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  39.22 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 202 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  37.33 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 202 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 175 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.09 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.09 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.88 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  37.75 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  37.75 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  36.42 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  35.76 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  35.33 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  35.33 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.77 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>