More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0065 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  65.36 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  64.47 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  50 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  46.75 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.95 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.06 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 165 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  36.42 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.47 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>