More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5902 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 165 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  68.1 
 
 		 165 aa  254  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 169 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 167 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  63.52 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  62.5 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 164 aa  197  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  54.97 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  54.97 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  53.25 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  52.6 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  51.95 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  51.95 
 
 		 158 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  46.1 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  44.68 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  44.14 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  41.78 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  44.14 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  44.14 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 217 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  39.01 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  44.29 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.22 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  43.08 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  42.86 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40.48 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  45.24 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  37.41 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>