More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3702 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  88.28 
 
 		 165 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  88.28 
 
 		 165 aa  237  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  88.28 
 
 		 165 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  74.42 
 
 		 165 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  74.6 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 159 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 167 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  50.39 
 
 		 159 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  49.61 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 163 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 163 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 165 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 163 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 163 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 165 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 164 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  45.24 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  46.4 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  44.8 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  44.8 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 164 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  42.64 
 
 		 164 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  44.09 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 158 aa  121  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 169 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  38.76 
 
 		 162 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.76 
 
 		 162 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  45.24 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 165 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 152 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  35.94 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 155 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  41.27 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 154 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  42.06 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.67 
 
 		 156 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 154 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.93 
 
 		 159 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 167 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 156 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 160 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 155 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 		 154 aa  104  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 159 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 167 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 155 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 157 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 153 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 155 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 167 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  42.5 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  39.52 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>