More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6022 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  98.08 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  95.48 
 
 		 156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  95.48 
 
 		 156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  95.48 
 
 		 156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  75.97 
 
 		 163 aa  257  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 156 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 169 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 175 aa  223  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  57.72 
 
 		 159 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  55.92 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  52.03 
 
 		 165 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  51.35 
 
 		 165 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.1 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 167 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 217 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  40.85 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  45.38 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  40.26 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.42 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.98 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  41.6 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.66 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  39.5 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 154 aa  97.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  39.5 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  35.92 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>