More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2730 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  324  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  60.51 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 169 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  57.43 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  56.76 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  55.41 
 
 		 165 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 159 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  54.55 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 217 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 164 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  43.23 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  39.73 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.77 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  39.73 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.73 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  39.04 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  39.04 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  34.69 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>