More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3838 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  311  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 		 154 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 		 154 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 		 154 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  98.7 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  96.75 
 
 		 154 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  93.51 
 
 		 154 aa  296  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1730  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  36.73 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  39.67 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 165 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 165 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.02 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  43.7 
 
 		 165 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 217 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  38.84 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  43.7 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  40.83 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 169 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  39.53 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  43.55 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  35.16 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  43.44 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  39.85 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.44 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  39.67 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  42.74 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 171 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  42.74 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  42.61 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  39.1 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>