More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000635 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 		 159 aa  330  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 158 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 159 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  53.74 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  54.48 
 
 		 165 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  53.79 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  52.2 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 217 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  44.06 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 194 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.86 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  42.86 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34.72 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  34.03 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  34.93 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  34.93 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>