More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5801 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  98.72 
 
 
156 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  96.13 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  95.48 
 
 
159 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  75.97 
 
 
163 aa  258  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  78.57 
 
 
156 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  76.62 
 
 
158 aa  249  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  70.59 
 
 
169 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 
175 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  57.05 
 
 
159 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
158 aa  168  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  55.17 
 
 
158 aa  155  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
165 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 
165 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  51.03 
 
 
165 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.56 
 
 
162 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
167 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 
164 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 
165 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  46.03 
 
 
217 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 
172 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 
164 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  40.14 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
194 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
164 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
158 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
168 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
157 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
161 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
164 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 
166 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 
163 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  45.38 
 
 
145 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
154 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
153 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
162 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
152 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 
159 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  39.61 
 
 
158 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
162 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
160 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  44.8 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
157 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  40.94 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  40.65 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  42.52 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.78 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.35 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>