More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3470 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  70.19 
 
 
165 aa  245  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  72.08 
 
 
165 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  72.08 
 
 
165 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  66.24 
 
 
158 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  74.42 
 
 
217 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  54.49 
 
 
159 aa  170  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  51.27 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
169 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 
156 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  48.97 
 
 
159 aa  158  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
156 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
163 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
156 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
158 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
164 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 
164 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
169 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
163 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
167 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
164 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
165 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
158 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
165 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
165 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  41.51 
 
 
162 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.51 
 
 
162 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  43.66 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
194 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
164 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
158 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
163 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 
155 aa  114  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 
154 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 
157 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.66 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.85 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  36.31 
 
 
163 aa  107  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.03 
 
 
154 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
165 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
156 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
154 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
166 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
154 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 
152 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
162 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 
154 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
154 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
158 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
154 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.55 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
152 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
169 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
162 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
152 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
153 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34.59 
 
 
158 aa  104  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
156 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
153 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
151 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
156 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
157 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
159 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  37.41 
 
 
165 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  40.34 
 
 
153 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
159 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
155 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  36.59 
 
 
160 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
154 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
172 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>