More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4380 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  343  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 156 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 156 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 163 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  66.67 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  65.93 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  51.59 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  49.37 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  49.37 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.97 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  39.49 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  34.39 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  43.31 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.52 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.86 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 167 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  36.3 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  36.3 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  38.31 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 153 aa  94.4  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 169 aa  94  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>