More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0059 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  331  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  80 
 
 		 158 aa  268  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  76.62 
 
 		 156 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  77.27 
 
 		 156 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  75.97 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  75.97 
 
 		 156 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  75.97 
 
 		 159 aa  257  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 175 aa  241  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 169 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  56.95 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  51.72 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  43.9 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 217 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  41.22 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  41.6 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  43.51 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.75 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.77 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 177 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  36.84 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  39.6 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.6 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.6 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>