More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4314 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  77.07 
 
 		 163 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 156 aa  247  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  72.44 
 
 		 158 aa  245  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 156 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 159 aa  243  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 156 aa  240  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 156 aa  240  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 169 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  55.17 
 
 		 159 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  49.66 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  48.97 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  48.28 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  46.9 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.56 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  43.97 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  43.97 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 158 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  40.14 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  38 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  38.17 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 159 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  37.4 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 153 aa  98.2  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 155 aa  97.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  34.67 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  35.86 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  39.23 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 156 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 162 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>