More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1129 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  40.14 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  41.67 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  36.65 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.96 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 163 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 158 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  37.59 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.53 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  30.46 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  29.8 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  29.8 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 167 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  33.07 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  34.46 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  30.47 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>