More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3786 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 157 aa  313  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  80.92 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  50.33 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  49.34 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.79 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38.16 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  38.82 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  38.82 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  38.82 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  34.87 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  42.38 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  41.72 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.21 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.76 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 196 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>