More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2805 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 153 aa  193  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  51.85 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  47.3 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.21 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.42 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.36 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  40.38 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.33 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.94 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  38.82 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  42.66 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.72 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  41.5 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>