More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1679 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  95.42 
 
 		 154 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 153 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  53.64 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 174 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  44.37 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.67 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 186 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 163 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>