More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2437 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  80.65 
 
 
159 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  77.42 
 
 
156 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
159 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
159 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
159 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
159 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
156 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 
161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
168 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  49.01 
 
 
168 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
154 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
181 aa  140  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
154 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
154 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
197 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
155 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
158 aa  133  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
153 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.15 
 
 
159 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
186 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
160 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.52 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
166 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  39.86 
 
 
156 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
188 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
156 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.86 
 
 
156 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  42.76 
 
 
151 aa  123  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
174 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
174 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.14 
 
 
169 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
152 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
153 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
157 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
156 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
160 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.45 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  37.69 
 
 
143 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
153 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
162 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
164 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
158 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
174 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  39.62 
 
 
162 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
156 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
173 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
172 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
157 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
156 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
154 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
196 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
162 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 
157 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>