More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0945 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  98.73 
 
 
157 aa  315  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  60.26 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 
157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 
158 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 
156 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  50.97 
 
 
171 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
161 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
153 aa  153  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
167 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
168 aa  147  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 
168 aa  147  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  44.65 
 
 
159 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
158 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
163 aa  140  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
186 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
197 aa  133  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.24 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.72 
 
 
156 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  43.24 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
157 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
156 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
202 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 
163 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
229 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  42.95 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.38 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.67 
 
 
156 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
156 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.74 
 
 
229 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
169 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
152 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.47 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
162 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
158 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
159 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
213 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
157 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
153 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
156 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 
155 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  40.4 
 
 
155 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
154 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
157 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 
161 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 
172 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
156 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
159 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
154 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
159 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
154 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  41.14 
 
 
158 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
161 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
158 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 
167 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 
167 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 
167 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
154 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.13 
 
 
159 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
155 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
155 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
159 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 
165 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
165 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
159 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
158 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>