More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4542 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  329  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 159 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 155 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  46.45 
 
 		 155 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.79 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 188 aa  143  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
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NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
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NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  36.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  36.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  36.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  36.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
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NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  36.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
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NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
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