More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1059 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 
157 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 
160 aa  175  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 
152 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 
174 aa  167  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
152 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 
152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  53.33 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
175 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
175 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
175 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
175 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 
155 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
202 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
229 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
202 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
175 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  51.32 
 
 
229 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
156 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
157 aa  157  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 
155 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
155 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 
149 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 
154 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
157 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 
158 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 
157 aa  151  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 
172 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
175 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
175 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
175 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
169 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
156 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
177 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 
153 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
154 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
162 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  51.03 
 
 
153 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 
213 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 
145 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
154 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  48.03 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
153 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
154 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
153 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.42 
 
 
152 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
161 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.39 
 
 
152 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 
158 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 
147 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  49.3 
 
 
144 aa  140  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  50 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
172 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 
155 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
166 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
161 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
155 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
154 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  45.83 
 
 
153 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
149 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
156 aa  133  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
157 aa  133  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 
153 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>