More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5805 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 152 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 152 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  51.97 
 
 		 152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 152 aa  170  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 152 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 151 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.76 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 229 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.33 
 
 		 229 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  42.21 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  39.39 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  41.06 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.16 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  40 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  40 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  43.31 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  39.87 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 181 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>