More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2230 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  94.19 
 
 
155 aa  299  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  85.71 
 
 
155 aa  282  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  68.63 
 
 
154 aa  219  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  69.13 
 
 
152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  68.63 
 
 
177 aa  218  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  69.13 
 
 
152 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  69.13 
 
 
152 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  69.13 
 
 
152 aa  216  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  69.13 
 
 
152 aa  215  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  67.33 
 
 
152 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  67.33 
 
 
152 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  67.33 
 
 
152 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  66 
 
 
152 aa  208  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  65.33 
 
 
152 aa  207  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  64.94 
 
 
154 aa  206  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
155 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
155 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
155 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
154 aa  190  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  55.84 
 
 
154 aa  190  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
154 aa  190  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 
154 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
154 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
154 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
154 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 
153 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 
154 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
181 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
155 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 
157 aa  140  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 
156 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
157 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
153 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.33 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.52 
 
 
162 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.1 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
153 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
157 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  44.37 
 
 
164 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 
155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 
167 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
175 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
175 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  43.79 
 
 
155 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  41.57 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.51 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  43.05 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
166 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
218 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
165 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>