More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5327 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  98.7 
 
 		 154 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  94.16 
 
 		 154 aa  298  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  57.24 
 
 		 152 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  57.24 
 
 		 152 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  57.24 
 
 		 152 aa  190  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 152 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  55.92 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 154 aa  176  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  52.63 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  51.3 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  47.4 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.81 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 175 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  44.37 
 
 		 229 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 229 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 202 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  44.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 222 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  44.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  44.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  44.31 
 
 		 222 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  44.31 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  44.31 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  44.31 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  39.87 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 175 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 213 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.76 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>