More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5150 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 154 aa  311  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 158 aa  275  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  84.97 
 
 		 157 aa  268  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  85.62 
 
 		 155 aa  267  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  83.66 
 
 		 156 aa  266  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  83.66 
 
 		 155 aa  265  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  83.01 
 
 		 155 aa  261  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 156 aa  227  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 213 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 169 aa  183  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 175 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 229 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 202 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  56.58 
 
 		 229 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 175 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  57.89 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 162 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  54 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 200 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 200 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 177 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.74 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  49.34 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  49.34 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.42 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.42 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  43.42 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 181 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.68 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  48.68 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  45.39 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.68 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  44 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.08 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.71 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.31 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.06 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  45.7 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>