More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1577 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  97.59 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  86.75 
 
 		 166 aa  295  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 166 aa  281  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 166 aa  278  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 		 166 aa  275  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  67.52 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 158 aa  204  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  65.81 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  65.16 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  65.16 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  65.13 
 
 		 160 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  60.14 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  60.14 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  56.95 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  57.43 
 
 		 155 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 175 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  56.08 
 
 		 155 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.33 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.61 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  46 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  46 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.33 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  46 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.12 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40.41 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  40.37 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.16 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  40.41 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  39.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>