More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1174 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  51.02 
 
 		 158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  41.26 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  36.24 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.86 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.48 
 
 		 156 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.79 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  31.79 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  90.9  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  30.97 
 
 		 164 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  32.26 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 152 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  31.29 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  31.29 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  31.61 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  31.29 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  31.76 
 
 		 166 aa  87.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  31.29 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>