More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6096 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  99.39 
 
 
165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  94.55 
 
 
165 aa  323  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  89.63 
 
 
167 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  88.27 
 
 
163 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  88.27 
 
 
163 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  88.27 
 
 
169 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  88.27 
 
 
163 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  88.27 
 
 
163 aa  297  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  76.1 
 
 
164 aa  262  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  68.1 
 
 
163 aa  254  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  69.94 
 
 
164 aa  251  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  71.95 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  70.99 
 
 
164 aa  250  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  65.22 
 
 
164 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  65.81 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  64.52 
 
 
158 aa  215  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  63.23 
 
 
158 aa  214  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  62.58 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  61.29 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  60.65 
 
 
158 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  61.25 
 
 
162 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  61.25 
 
 
162 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  60.65 
 
 
194 aa  207  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  59.35 
 
 
158 aa  204  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  49.3 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
165 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 
165 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  46.5 
 
 
158 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
159 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 
217 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 
161 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  41.55 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  48.57 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
167 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  45.39 
 
 
164 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
168 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  47.86 
 
 
167 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  45.39 
 
 
164 aa  123  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  45.39 
 
 
164 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  45.39 
 
 
164 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  47.14 
 
 
167 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  45.39 
 
 
164 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
156 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 
163 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
177 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  45 
 
 
164 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
158 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  45.71 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  46.43 
 
 
165 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  47.69 
 
 
144 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 
164 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  43.57 
 
 
158 aa  121  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.92 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
169 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
156 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
156 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
157 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  44.14 
 
 
158 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  44.29 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  49.59 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
159 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.318604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>