More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3168 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  75.8 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  75.8 
 
 		 165 aa  254  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  75.8 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  74.6 
 
 		 217 aa  202  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  52.2 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 156 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 165 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 165 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  47.5 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  46.71 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.04 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  37.65 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1129  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.883194  hitchhiker  0.000426567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.31 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  40.27 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  41.06 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  41.06 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  40.27 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.31 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>