More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2933 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  338  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
163 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
169 aa  251  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  72.33 
 
 
167 aa  251  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  71.95 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  71.95 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  70.55 
 
 
165 aa  244  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  74.68 
 
 
164 aa  244  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  68.75 
 
 
164 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  71.61 
 
 
164 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  69.38 
 
 
164 aa  233  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 
158 aa  217  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  61.94 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  62.58 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  61.94 
 
 
158 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  60.65 
 
 
162 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  60.65 
 
 
162 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  62.42 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  61.29 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  60.65 
 
 
194 aa  208  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  59.38 
 
 
163 aa  208  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 
158 aa  204  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  48.34 
 
 
158 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  44.65 
 
 
165 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
165 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 
165 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
165 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
159 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
158 aa  141  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  47.89 
 
 
159 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  49.21 
 
 
217 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  47.92 
 
 
164 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  47.71 
 
 
165 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  45.86 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
158 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 
167 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  46.53 
 
 
164 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
156 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
156 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
156 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  48.67 
 
 
168 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  52.85 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  46.05 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 
167 aa  131  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 
167 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  46.53 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 
164 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
169 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 
164 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 
164 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
157 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  44.9 
 
 
161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
156 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
169 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  45.32 
 
 
158 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
154 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.75 
 
 
181 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>