More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2050 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  59.18 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 164 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  60.54 
 
 		 164 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  55.78 
 
 		 164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  55.1 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 196 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  52.78 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  51.37 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  51.37 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 167 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  48.63 
 
 		 165 aa  156  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  49.32 
 
 		 168 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  154  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  47.97 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  47.97 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  49.31 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  47.97 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  48.61 
 
 		 164 aa  153  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 163 aa  151  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  48.61 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  46.67 
 
 		 155 aa  147  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  47.22 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2760  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  43.45 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  49.32 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  43.45 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.45 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  43.45 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  43.45 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  42.76 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.97 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  40.97 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  40.97 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  40.97 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  40.97 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>