More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2815 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
169 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
163 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
162 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 
162 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
164 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 
158 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
194 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
164 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  38.3 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1488  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
165 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6569  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
165 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5902  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4314  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0419553  normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
156 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
156 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3066  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00609766  hitchhiker  0.00646001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
156 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
156 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
159 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
181 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
157 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
167 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
158 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
152 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1174  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
177 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313461  normal  0.325282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.16 
 
 
156 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  34.01 
 
 
159 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 
161 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
171 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3465  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.33 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  36.65 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.66 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  42.2 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4380  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
200 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  41.46 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  42.2 
 
 
154 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>