More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3248 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 156 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 156 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 155 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.12 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  46 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 175 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 155 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  46.67 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 161 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 153 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 157 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 161 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 161 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 147 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.41 
 
 		 162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  42.21 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.96 
 
 		 156 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 171 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.59 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.67 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 163 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.68 
 
 		 169 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 167 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.94 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.87 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  41.67 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 154 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>