More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2442 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  75.82 
 
 		 170 aa  236  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  59.48 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  51.68 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  46.82 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  50.67 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  52.45 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  52.45 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  52.24 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.67 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.79 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  40.25 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.75 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.91 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  41.48 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  41.48 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.16 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  41.48 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  41.94 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>