More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0615 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  337  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  81.93 
 
 		 166 aa  286  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  78.92 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 166 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 166 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  80.12 
 
 		 166 aa  278  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  77.91 
 
 		 166 aa  261  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 161 aa  249  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 155 aa  214  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 158 aa  207  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 164 aa  206  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  62.42 
 
 		 157 aa  206  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 176 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 160 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 157 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  61.64 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  61.64 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  60.53 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  57.72 
 
 		 170 aa  173  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  56.76 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  58.74 
 
 		 175 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 168 aa  170  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.64 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 158 aa  128  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.94 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  40.13 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  41.38 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.98 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  39.62 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.13 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 202 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.35 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 229 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  37.91 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 202 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>