More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2653 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  86.75 
 
 		 166 aa  299  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  87.95 
 
 		 166 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  86.75 
 
 		 166 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  86.75 
 
 		 166 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 166 aa  286  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  81.99 
 
 		 166 aa  268  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 155 aa  213  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  68 
 
 		 164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 157 aa  210  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  62.03 
 
 		 160 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 170 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  61.94 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 180 aa  183  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  60.81 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  60.81 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  60.93 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  59.46 
 
 		 155 aa  177  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  59.31 
 
 		 175 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 		 170 aa  173  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  58.11 
 
 		 155 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.62 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  40.76 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.96 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>