More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0409 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  323  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.2 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  34.19 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  34.18 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>