More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1509 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  95.57 
 
 
166 aa  307  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  75.66 
 
 
172 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 
156 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 
159 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  52.26 
 
 
159 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  45.12 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
151 aa  124  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 
171 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
218 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.04 
 
 
162 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
157 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
170 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 
174 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  41.21 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  41.21 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  41.21 
 
 
222 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  41.21 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  41.21 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  41.21 
 
 
222 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  41.21 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  41.21 
 
 
168 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  41.21 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
159 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
157 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.85 
 
 
159 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
176 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
163 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
188 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
155 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
160 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
156 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
154 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
167 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
156 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  40.13 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>