More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3502 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  97.48 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  86.08 
 
 		 158 aa  278  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  85.44 
 
 		 160 aa  268  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 155 aa  245  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  47.77 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  41.61 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  40.85 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  37.58 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  36.99 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 152 aa  97.1  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.3 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  31.54 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 154 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  31.54 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  31.54 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  31.54 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>