More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  74.67 
 
 
150 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  75.33 
 
 
150 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  75.5 
 
 
153 aa  233  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  73.33 
 
 
150 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  73.33 
 
 
150 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  72.67 
 
 
150 aa  220  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  71.33 
 
 
150 aa  212  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  67.11 
 
 
150 aa  203  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  67.79 
 
 
150 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  57.33 
 
 
151 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 
151 aa  173  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
150 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
166 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
158 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
196 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.71 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
158 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
178 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
159 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
153 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  38.67 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
156 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
159 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 
152 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
157 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  41.89 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  41.89 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
172 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
167 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
154 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
153 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
166 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
169 aa  110  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  41.55 
 
 
164 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
159 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
159 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
164 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
159 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  41.55 
 
 
167 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.25 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
195 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>