More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0737 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
160 aa  320  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  90.51 
 
 
158 aa  286  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  85.44 
 
 
159 aa  268  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  85.44 
 
 
159 aa  268  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  77.42 
 
 
155 aa  240  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
159 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
152 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
172 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
156 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
166 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  39.35 
 
 
158 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
159 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
150 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
166 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
150 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
155 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
150 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
161 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
168 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
161 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
150 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 
172 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
155 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
155 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
163 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 
155 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  37.82 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
151 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  36.3 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
213 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  40.85 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.36 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
159 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
180 aa  94.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
152 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  94  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>