More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4274 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  61.22 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 		 155 aa  170  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  52.7 
 
 		 173 aa  159  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  44.72 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 		 171 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  48.28 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  47.22 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.82 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 218 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  32.87 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  33.73 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  33.73 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  33.73 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  33.73 
 
 		 222 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  33.73 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  35.1 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  33.73 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  37.86 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  33.11 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>