More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4446 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  80.77 
 
 
158 aa  256  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  78.15 
 
 
159 aa  245  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  78.81 
 
 
159 aa  245  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  77.42 
 
 
160 aa  240  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
159 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 
159 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
152 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
156 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  40.91 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
156 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
166 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
157 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
159 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
163 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 
157 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
163 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
157 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
152 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
152 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
152 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
150 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
150 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  36.18 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  38.41 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.22 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
154 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
166 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  37.33 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 
157 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  38.16 
 
 
158 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  36.42 
 
 
155 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.1 
 
 
159 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
158 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
175 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 
154 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
162 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
158 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
154 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40 
 
 
162 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
153 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
154 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
155 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
162 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
162 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
157 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>