More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2886 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  70.86 
 
 
172 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  63.58 
 
 
166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
155 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 
165 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  43.27 
 
 
218 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  43.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  43.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  43.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  43.11 
 
 
222 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  43.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
222 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.04 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  42.69 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.51 
 
 
168 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
167 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.59 
 
 
165 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  42.69 
 
 
174 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.51 
 
 
168 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
174 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
174 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
174 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
174 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  43.62 
 
 
176 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
158 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
157 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
160 aa  121  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
163 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
154 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.16 
 
 
156 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 
171 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
157 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
159 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
160 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 
164 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
152 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
152 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
160 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>